Loa hidroaviones sólo pueden despegar y amerizar cuando no hay olas o éstas son muy pequeñas, y, como a cualquier otra aeronave, el mal tiempo les impone limitaciones. El tamaño de las olas con las que un modelo determidnado puede amerizar depende del tamaño del avión y de sus características.

Los hidroaviones de flotadores tienen más limitaciones que los de casco, que son en general más estables en el agua que los primeros.